这部电影讲述的是关于东京都郊区一系列的不分青红皂白的爆炸案的。一辆大巴车在白天，在所有人的注视下，发生了剧烈的爆炸，导致了大巴车上所有人的死亡。这一连串的反常事件，让警察们对此产生了极大的重视，生性粗犷，但有一颗正直的心的茶屋，就是其中之一。
茶屋追踪嫌犯绿川纪子至其隐藏之处，但目睹绿川与另外一名男子交手，然后引爆其隐藏之处逃离。那个男人被茶屋里的人送到了警局，但并没有透露出更多的细节，只说对方的名字叫做“铃木一郎”。从那时起，铃木就被认定为这起爆炸事件的共犯，并进行了心理评估。主治医师鹰谷真丽也注意到了，他的身体素质很好，但他的动作却像是一台精密的机械。所有这些都推动了真里香对铃木过往的研究。
在一系列的调查之后，关于铃木家神秘而又阴暗的背景逐渐被揭露出来。他的真名叫桃达伟，从小就因为车祸去世。之后，大威被富有的外公陶伦行领养，但外公并没有给孙子带来任何温暖，反而在他心里埋下了仇恨的种子。伦行利用了达伟过人的智慧，把他培养成了一个没有任何情感的杀戮机器，被人戏称为“脑男”。受到大威悲惨遭遇的感动，真梨不顾一切地想要帮助这个年轻人恢复失去的人类本性。而在这段时间里，茶屋方面也进行了大量的侦查，发现了一件事，那就是铃木并没有杀死绿川幸纪的意思。
没过多久，载着铃木的囚车上就受到了绿川纪子与水泽尤里亚的攻击，他们的任务就是把铃木从连环火药爆炸事件中剔除出去。在战斗中，铃木被水泽攻击，囚车爆炸，两人趁此机会逃走。一星期之后，绿川挟持了真梨，出现在了医院里，警察们包围了这栋楼，这栋楼很有可能会有猛烈的爆炸声。没过多久，铃木来到了他的身前，一场纠缠不清的战斗开始了。
关于人性始终维持着“人之初，性为恶”的观念，倒不是说对其有多么的绝望，只是认为，人不可能强大到可以放弃一切懦弱，卑鄙，自私等心态。邪恶就像是一株生长在黑暗中的花朵，它的根须很难被拔除，只有那些天生邪恶的人才能将其拔除。以茶屋罪犯和真梨子医生为首的一群人，他们以文明的名义制定了道德底线和法律标准，充当着这个世界的守护者，他们认为有罪的人应该受到法律的制裁，但他们一再声称没有足够的证据，他们认为有罪的人可以改邪归正，但他们最重要的病人出卖了。
因此，某些邪恶并不一定要得到拯救。当故事讲到中途，许多人都在回忆着这个男人的经历时，她感觉到了一种嘲讽，那是一个有理智的人在同情这个男人吗？或者说，他在同情一个杀戮机器的命运？不过，就像他的外公说的那样，只有那些没有被这个世界玷污的人，才能看到这个世界的残酷。那些喊着要用法律来惩罚坏人的人，在面对要杀自己孩子的时候，他们会出于对自己亲人的尊重而做出自己的选择，他们会认为，在这种情况下，即使我杀死了那个大脑，也不会受到任何谴责。
在把他送走之前，千里香博士用自己痛苦的经验对他说：有的时候，坏人可以洗心革面，只要我们肯出手。想要用自己真诚的情感来感化这个脑子有毛病的男人，但话里话外都带着一种对自己拯救行动的预感。然而，事实就像《告白》里说的那样，《少年法》就像是一张保护伞，将那些邪恶的人牢牢地套在了自己的身上。也正因为如此，绿川纪子一直没有将自己的家人和亲人的死与自己的死联系在一起，最终成为了一个嗜血的杀手。
这也是为什么，当她看到杀死自己儿子的凶手被杀死的消息时，她会痛哭流涕地说：“神是存在的。”有的时候，邪恶是不会被拯救的，因为邪恶已经根深蒂固，不会被太阳照射，也不会被雨水冲刷。这也是为什么，他能够清楚地知道，志村在他离开之后，又做了什么。
收到这封信的时候，她急匆匆的跑到了她最需要的病人家里，还没有等她开始哭泣，就听到了小女孩的哭声。精神科医师站在了人类社会的对立面，他的信仰在这一刻被彻底摧毁。而这种具有嘲弄意味的结局，正是这部电影的重头戏。